Ваш сын имеет право на отсрочку по учебе. Отсрочка предоставляется призывной комиссией годному по здоровью призывнику. То есть для того, чтобы получить отсрочку, нужно состоять на воинском учете, подать справку из колледжа и заявление с просьбой предоставить отсрочку, пройти медицинское освидетельствование, получить категорию годности А или Б, после этого явиться на заседание призывной комиссии и получить там отсрочку и отметку о ней в приписном. Если присваивается категория В, то призывник зачисляется в запас и получает военный билет, отсрочка ему не предоставляется, но и на службу его не призывают - он уже в запасе. Если присваивают категорию Г, то дают отсрочку по здоровью, а по ее окончании снова проводят освидетельствование и снова рассматривают вопрос о годности.

То есть тот  факт, что при первичной постановке на воинский учет ваш сын не прошел врачей, ему не была присвоена категория годности, и вообще были перепутаны его данные - это нарушение работы военкомата. На это можно отправить жалобу в вышестоящий военкомат и военную прокуратуру. Но для получения отсрочки ему все равно нужно взять справку в колледже, прийти с ней в военкомат и заодно донести все недостающие документы, написать заявление на предоставление отсрочки, пройти медосвидетельствование и призывную комиссию, которая и присвоит категорию годности и даст отсрочку.

Наши рекомендации по подготовке к медкомиссии вы найдете здесь.